来源:微博@罗法老
???昨天有个美国医生说自己一月初得了“重感冒”，4月份做了新冠抗体检测呈阳性，认为那个“重感冒”其实是新冠肺炎。这么明显的证据摆出来有些网友坐不住了，非说他一月得的是感冒，然后又无症状感染新冠肺炎所以才检测阳性……..我只能无语……..
还好现在已经有快600个美国病人的病毒序列上传，我们可以做个直观的分析：
?根据上图我们能分析出以下2点：
1、美国病例涵盖了世界各个地区新冠病毒序列的所有分支，具有最丰富的多样性。
2、美国的病毒序列涵盖了从病毒0突变到最远的22个突变（之前还有26个突变的数据被改了，中国内地截至2月底的突变数量不超过10个）。之前有人反驳说，美国是世界人种大混合的地方，难道可以以此推断美国就是人类发源地吗？这么说是有道理，但请看上图，美国不仅有最原始的病毒0突变类型，也有进化最远的病毒最新类型，且世界各个地区的病毒最原始类型都能在美国找到。好比你去找人类发源地，发现有个地方集中了元谋人、尼安德特人、非洲南方古猿的化石….你能否认这个地方是人类发源地吗？
还有人提问如果美国是病毒发源地，那美国的新冠肺炎应该早就爆发了啊，为什么要这么晚才爆发？
问得好。在回答这个问题之前，先要回顾一下美国杜兰大学医学院教授罗伯特 加里上星期对病毒进化的一段评论：“表面蛋白的突变可能是触发这次大流行的原因，但是在积累到目前情况之前，这种病毒的较弱版本已经在人群中传播了数年，甚至几十年”。
以纽约的病毒爆发为例，分析一下下图：
?上图可以看到，纽约提交的43条序列涵盖4个病毒序列分支，数量最多的分支是最上面的一支，这个分支在欧洲的病例数据最多，所以我们把它称作“欧洲支”。也就是说，病毒分多个传染源进入纽约，但只有所谓“欧洲支”因为某种原因爆发了。按照加里教授的解释是，病毒存在相当长时间的潜伏状态，期间可能只感染很少的人症状也不明显，可一旦病毒突变成适应人群的形态就开始了大爆发。
再看看疫情比较严重的华盛顿州的数据。
?华盛顿州的序列数据比纽约分布的病毒分支更多，病毒突变更远。所以，不用看新闻仅通过数据分析就可以判断华盛顿州爆发疫情的时间比纽约早，实际情况和这个分析的结果是一致的。
回过头来分析下中国疫情的源头：
1、中国控制住病毒人传人后就控制住了疫情，至今中国没有发现或证明动物传染人或其他别的什么传染途径。由此可以断定病毒最早进入武汉就是通过人带入的，且武汉的人口密集度高，比人口分散的美国更有利于病毒传播。
2、中国只是在武汉一个城市疫情大爆发，说明病毒在中国的传播并不深入且时间短。而美国疫情的爆发是全国性的，比较主要的爆发点就有华盛顿州、加州、路易斯安那州、纽约州等等，说明美国被病毒侵入的非常彻底，之前华盛顿州和纽约的序列分析也证明美国各个州都存在病毒的多个分支，这肯定需要很长时间的传播积累才能实现，。
3、把武汉默认为是病毒发源地是不妥的。基因树上能从所谓武汉爆发根部找到很多无法解释来源的外国序列，这些外国序列很多还是三月份测的，更说明病毒进化有未发现的更早的传染链。
如今意大利已经确认了最早1月1日的病例（还有更早的有待开棺确认）。其他国家也逐渐找到更早的病毒病例，都是无法和中国建立起联系的。
